Después de realizar estudios de pertinencia en los contextos tecnológicos, académicos, de demanda educativa y de demanda de los sectores productivos y gubernamentales, el Colegio de Profesores del Programa aperturó, en marzo del 2018, el Programa de Doctorado en Ciencias en Sustentabilidad de los Recursos Naturales y Energía.
El objetivo del Programa es contribuir al desarrollo del país mediante actividades de investigación científica/tecnológica, y a la formación de recursos humanos especializados capaces de realizar investigación original e independiente en las áreas de sustentabilidad de recursos naturales y energía.
La modalidad del Programa es el Doctorado tradicional, por lo que el aspirante debe poseer el grado de Maestría en Ciencias. Además, tiene un diseño curricular de 48 meses y cuenta con dos Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento: i) Energía sustentable y ii) Sustentabilidad de los recursos naturales.